CMAPLE
1.0.0
C++ MAximum Parsimonious Likelihood Estimation
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Here is a list of all documented enum values with links to the class documentation for each member:
- b -
BIN_TREE :
cmaple::Tree
BLOSUM62 :
cmaple::ModelBase
- c -
CPREV :
cmaple::ModelBase
- d -
DAYHOFF :
cmaple::ModelBase
DCMUT :
cmaple::ModelBase
DEFAULT :
cmaple::ModelBase
- e -
EXHAUSTIVE_TREE_SEARCH :
cmaple::Tree
- f -
FAST_TREE_SEARCH :
cmaple::Tree
FLAVI :
cmaple::ModelBase
FLU :
cmaple::ModelBase
- g -
GTR :
cmaple::ModelBase
GTR20 :
cmaple::ModelBase
- h -
HIVB :
cmaple::ModelBase
HIVW :
cmaple::ModelBase
- i -
IN_AUTO :
cmaple::Alignment
IN_FASTA :
cmaple::Alignment
IN_MAPLE :
cmaple::Alignment
IN_PHYLIP :
cmaple::Alignment
IN_UNKNOWN :
cmaple::Alignment
- j -
JC :
cmaple::ModelBase
JTT :
cmaple::ModelBase
JTTDCMUT :
cmaple::ModelBase
- l -
LG :
cmaple::ModelBase
- m -
MTART :
cmaple::ModelBase
MTINV :
cmaple::ModelBase
MTMAM :
cmaple::ModelBase
MTMET :
cmaple::ModelBase
MTREV :
cmaple::ModelBase
MTVER :
cmaple::ModelBase
MTZOA :
cmaple::ModelBase
MUL_TREE :
cmaple::Tree
- n -
NONREV :
cmaple::ModelBase
NORMAL_TREE_SEARCH :
cmaple::Tree
NQ_BIRD :
cmaple::ModelBase
NQ_INSECT :
cmaple::ModelBase
NQ_MAMMAL :
cmaple::ModelBase
NQ_PFAM :
cmaple::ModelBase
NQ_PLANT :
cmaple::ModelBase
NQ_YEAST :
cmaple::ModelBase
- p -
PMB :
cmaple::ModelBase
- q -
Q_BIRD :
cmaple::ModelBase
Q_INSECT :
cmaple::ModelBase
Q_MAMMAL :
cmaple::ModelBase
Q_PFAM :
cmaple::ModelBase
Q_PLANT :
cmaple::ModelBase
Q_YEAST :
cmaple::ModelBase
- r -
RTREV :
cmaple::ModelBase
- s -
SEQ_AUTO :
cmaple::SeqRegion
SEQ_DNA :
cmaple::SeqRegion
SEQ_PROTEIN :
cmaple::SeqRegion
SEQ_UNKNOWN :
cmaple::SeqRegion
- u -
UNKNOWN :
cmaple::ModelBase
UNKNOWN_TREE :
cmaple::Tree
UNKNOWN_TREE_SEARCH :
cmaple::Tree
UNREST :
cmaple::ModelBase
- v -
VT :
cmaple::ModelBase
- w -
WAG :
cmaple::ModelBase
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